Dans toute l’Europe et au-delà, la protéomique s’impose comme un outil essentiel pour comprendre la biologie humaine d’une manière que la génomique, à elle seule, ne peut offrir.
Des scientifiques de haut niveau de Bristol Myers Squibb, Pfizer et AstraZeneca ont souligné comment le passage à l’échelle de la protéomique transforme la recherche et la médecine.
La capacité d’analyser des dizaines de milliers d’échantillons, rendue possible par des ressources telles que la UK Biobank, marque un tournant. La spectrométrie de masse est désormais largement utilisée dans les essais cliniques, où elle peut identifier des biomarqueurs, prédire l’évolution des maladies et offrir une plus grande sensibilité.
Contrairement au génome, qui est statique, les protéines évoluent en permanence, et la protéomique permet de saisir ces dynamiques dans le temps. Cela fournit des informations précieuses pour la détection précoce, même si des défis subsistent concernant la disponibilité des échantillons et la variation biologique.
Développement de médicaments de nouvelle génération
Des plateformes telles qu’Olink et SomaLogic mesurent déjà des milliers de protéines, mais pas l’ensemble du protéome ni ses nombreuses variantes. La plupart des études reposent sur le plasma, même si de nombreuses protéines ne peuvent pas être détectées dans le sang, ce qui renforce l’importance de développer des alternatives accessibles. Des outils complémentaires, tels que la métabolomique et l’imagerie, sont utilisés pour traduire les résultats complexes issus des tissus en signaux susceptibles d’orienter le traitement.
Au-delà de la recherche, la protéomique de nouvelle génération fait progresser la découverte de médicaments. De nombreuses cibles pathologiques sont encore considérées comme indéverrouillables (« undruggable ») parce que leur surface ne possède pas les poches de liaison nécessaires aux médicaments traditionnels. La spectrométrie de masse par acquisition indépendante des données (DIA-MS) change la donne en cartographiant les interactions protéine-ligand avec rapidité et précision.
Le leadership d’Evotec en protéomique
Evotec, une entreprise disposant de l’une des plus grandes installations de spectrométrie de masse au monde, est à la pointe dans ce domaine avec des plateformes telles que HT-ABPP, HT-PALMS et ScreenPep. Ces systèmes permettent un criblage automatisé et à haut débit de centaines de milliers d’échantillons chaque année, favorisant la découverte d’inhibiteurs covalents comme réversibles.
Pour les chercheurs français, ces avancées montrent que la protéomique ne se contente pas de compléter la génomique ; elle ouvre également de nouvelles voies vers des thérapies innovantes.